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La serie se centra en Lain Iwakura, una chica que vive su adolescencia en los suburbios de Japón y sobre su introducción al Wired, una red mundial de comunicaciones similar a Internet. Lain vive con su familia de clase media la cual se compone también de una inexpresiva hermana mayor llamada Mika, una madre fría y un padre obsesionado por las computadoras.